RKiPSV centar
Centar za razvoj kvalifikacija i podršku sektorskim većima NOKS-a (u daljem tekstu: RKiPSV centar) se bavi uređivanjem sistema kvalifikacija, poslovima razvoja kvalifikacija, istraživačkim i analitičkim poslovima za potrebe rada sektorskih veća, poslovima izrade standarda i programa stručnog osposobljavanja i obuke prema vanškolskim propisima kao i dodatnih standarda kvaliteta rada u oblastima pripreme Nacionalnog okvira kvalifikacija iz delokruga sektorskog veća sa kojim koordinira. Centar se, takođe, bavi osiguranjem kvaliteta u razvoju, sticanju, dodeljivanju i priznavanju kvalifikacija stečenih formalnim, neformalnim i informalnim putem.
ENIC/NARIC centar
ENIC/NARIC centar je organizaciona jedinica Agencije za kvalifikacije koja sprovodi postupak priznavanja strane školske isprave. Postupak priznavanja strane školske isprave se sprovodi u skladu sa odredbama Zakona o Nacionalnom okviru kvalifikacija Republike Srbije („Sl glasnik RS“, br.27/18 i 6/20), ako međunarodnim ugovorom nije predviđeno drugačije.
JPOA centar
Centar za akreditaciju javno priznatih organizatora aktivnosti obrazovanja odraslih (u daljem tekstu: JPOA centar) je organizaciona jedinica Agencije za kvalifikacije, koja obavlja poslove davanja odobrenja za sticanje statusa javno priznatog organizatora obrazovanja odraslih i poslove osiguranja kvaliteta u neformalnom obrazovanju, koji su Zakonom o Nacionalnom okviru kvalifikacija Republike Srbije povereni Agenciji.